1、泌尿系统感染：泌尿生殖道的炎症可直接影响睾丸生精功能，还可以使血液或者精液中产生抗精子抗体，影响精液的酸碱度，加上病原体对精子的直接杀伤作用，可造成精子减少。
2、精索静脉曲张：使睾丸的局部温度升高，血管活性物质增加，影响睾丸生精功能，曲张的精索静脉程度与精子质量不成比例。
3、隐睾：隐睾会影响精液质量，单侧隐睾约60%会不育，若精子密度低，又有隐睾存在，必须尽快治疗。
4、内分泌异常：正常的男性生精功能依赖于下丘脑-垂体-性腺轴功能的正常，任何一个环节出现障碍，都影响到生精功能，如甲状腺、肾上腺疾病也会影响生殖腺功能而致少精子症。
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